Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TriobpQ99KW3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms