Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dok4Q99KE3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms