Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TrabdQ99JY4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrabdQ99JY4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TrabdQ99JY4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TrabdQ99JY4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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