Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin3Q99JB8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms