Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ophn1Q99J31 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms