Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms