Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sntg1Q925E1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sntg1Q925E1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms