Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prpf3Q922U1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf3Q922U1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms