Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med28Q920D3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med28Q920D3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms