Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cts3Q91ZD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms