Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms