Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms