Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Odf4Q8VI88 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf4Q8VI88 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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