Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms