Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmcd1Q8VEE1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms