Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rdh10Q8VCH7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh10Q8VCH7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms