Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan10Q8VCF5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan10Q8VCF5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan10Q8VCF5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan10Q8VCF5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms