Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med17Q8VCD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med17Q8VCD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms