Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms