Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms