Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxc12Q8K5B8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms