Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw1Q8K4P8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms