Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrtm1Q8K377 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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