Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf39Q8K2Z2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf39Q8K2Z2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms