Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrdQ8K2M3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms