Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Nek9Q8K1R7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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Nek9Q8K1R7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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