Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn34c1Q8K193 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34c1Q8K193 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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