Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms