Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfm1Q8K0D5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms