Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbrd1Q8K0B2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbrd1Q8K0B2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms