Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms