Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LgsnQ8CIX8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LgsnQ8CIX8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms