Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prmt5Q8CIG8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms