Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rab11fip3Q8CHD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rab11fip3Q8CHD8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms