Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms