Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms