Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd1bQ8CFT2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Setd1bQ8CFT2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd1bQ8CFT2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms