Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx8Q8CFD4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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