Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8CF25 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8CF25 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8CF25 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms