Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms