Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp27Q8CEG8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Usp27Q8CEG8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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