Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam228aQ8CDW1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam228aQ8CDW1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms