Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms