Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q8C5C9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C5C9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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