Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx16Q8C080 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Snx16Q8C080 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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