Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sall4Q8BX22 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sall4Q8BX22 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms