Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ctdsp2Q8BX07 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms