Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp38Q8BW70 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp38Q8BW70 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp38Q8BW70 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms