Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Als2cr12Q8BVM7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms