Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx17Q8BVL3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms